化疗是肺癌患者主要的治疗手段之一，而化疗会导致肺癌患者肠道菌群显著改变：导致肠道益生菌减少，致病菌增加。

含铂双药化疗方案是晚期肺癌患者的标准一线化疗方案，有研究通过30名接受含铂方案化疗的肺癌患者治疗前后的分辨菌群分析发现：化疗后肠道内的益生菌如双歧杆菌、乳酸杆菌、柔嫩梭菌属、胃球菌数的数量减少，致病菌如肺炎克雷伯杆菌数量增加。与另外两项研究：小细胞肺癌经依托泊苷+顺铂后梭状芽胞杆菌增加，非小细胞肺癌经含铂化疗后挑剔真杆菌数量增加，结果基本一致。

这种菌群改变与化疗后免疫力下降导致感染几率增加是否有关尚不清楚。

肠道共生菌可能参与了抗肿瘤反应。益生菌联合化疗可能有协同作用（增加化疗的疗效）。小鼠实验中，顺铂联合混合抗生素，小鼠存活率显著降低，而顺铂用于乳酸杆菌处理的小鼠，肿瘤被良好控制且存活率更高。

有研究指出机制可能是顺铂联合混合抗生素使癌基因——血管内皮生长因子A（VEGFA）表达增加，抑癌基因BAX、CDKN1B表达下降。可能也与调节机体抗肿瘤免疫力相关。

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