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    中国非小细胞肺癌基因谱和免疫学特征

    2019-05-10

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    作者: 广东省人民医院官网


    一直以来,中国肿瘤学专家都在努力探索中西方肺癌患者基因谱和免疫学的差异,这对于中国肺癌患者靶向治疗的选择和发展具有重要意义。

    2019年4月16日,我院广东省肺癌研究所团队报道了关于“中国非小细胞肺癌基因谱和免疫学特征(CHOICE研究)”的最新研究成果。肺癌研究所张绪超所长(第一作者)、吴一龙教授(通讯作者)领衔北京大学人民医院、吉林大学第一医院等单位的肿瘤学专家,撰文《Comprehensive genomic and immunological characterization of Chinese non-small cell lung cancer patients》正式发表在国际Nature子期刊《Nature Communications》杂志上(中科院二区,IF=12.41),这是一本在线多学科期刊,致力于在生物、物理和化学科学的所有领域发表高质量的研究,该杂志发表的论文代表了各领域专家的重要进展。

    在CHOICE研究中,采用全基因组拷贝数生物芯片技术、全外显子组和转录组二代测序技术产生的多维组学数据,分析了245例中国非小细胞肺癌患者的基因谱和免疫学特征,结果与TCGA基因数据库(数据主要来源西方人群)进行比对,发现我国和西方肺癌患者的基因突变即存在相似性,也存在一些不同的基因突变情况。中国CHOICE研究人群染色体上8p23.1丢失的频率较高,而西方人群则染色体上8q24.21的局灶性扩增和肿瘤抑制因子lrp1b的局灶性缺失较高。在我国非小细胞肺癌人群中,肿瘤浸润淋巴细胞肺腺癌(72.5%)明显高于肺鳞癌(54.4%);在肺腺癌中免疫细胞浸润低水平与EGFR基因突变有关,且免疫T细胞浸润与KRAS基因突变显著相关,而在肺鳞癌中免疫细胞浸润低水平则与PI3K和/或Wnt途径激活有关。

    本研究还采用了肿瘤免疫微环境各浸润炎症免疫细胞成分“去卷积”分析方法,建立了微环境的免疫分子标签,计算每个患者的免疫标签得分,发现具有高抗原呈递机制和细胞毒性T细胞标记评分的鳞癌患者具有较好的预后意义。

    本次CHOICE研究为中国非小细胞肺癌人群中潜在生物标志物的特征提供了全面的描述性数据。这些数据对进一步分析分子标志物、分子机制提供了重要线索。张绪超所长充满信心的表示,课题组还将进一步挖掘免疫组学数据,后续发表更有影响力的成果。

    吴一龙教授也表示,肺研所联合全国6家医院,发布了目前中国最全的肺腺癌和肺鳞癌的免疫基因组分析—CHOICE研究:中国肺腺癌的免疫细胞标签明显高于肺鳞癌,根据基因组变异、拷贝数增加、融合基因、肿瘤突变负荷和肿瘤浸润淋巴细胞的综合计算,高综合免疫标签的患者几乎是100%的生存,优于其他的免疫标签对预后的预判。张绪超牵头的这项研究,信息量之丰富,超乎想象,还有巨大的发掘空间!

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    新年伊始,肺研所张绪超所长已带领肺癌团队取得较好的科研成绩。2月张绪超和吴一龙教授领衔中国临床肿瘤学会肿瘤生物标志物委员会(CSCO-TBC)执笔撰写了“二代测序技术在肿瘤精准医学诊断中的应用中国专家共识”,即《Application of next-generation sequencing technology to precision medicine in cancer: joint consensus of the Tumor Biomarker Committee of the Chinese Society of Clinical Oncology》正式发表在《Clinical Cancer Biology》(中科院二区,IF=4.607)杂志。今年3月张所长研究生尹凯发表科研成果《A molecular graded prognostic assessment(molGPA) model specific for estimating survival in lung cancer patients with leptomeningeal metastases》在肺癌老牌国际杂志《Lung Cancer》上(中科院三区,IF=4.684)。最近,张所长研究生尹凯、黎琳琳已投稿摘要在2019年世界肺癌大会(WCLC)和中国肿瘤学大会(CCO)多篇。今年肺癌研究所的科研成果已经硕果累累,相信在这个科研平台的支撑与培养下将取得更大的科研业绩,逐步将具有应用价值的标志物转化应用于临床,从而造福肺癌患者。

    知识无涯。我们将秉持上下求索、努力拼搏的精神,在我院“顶天立地”的战略指引下,继续奋斗,争取产出更多的成果。


    作者:广东省人民医院官网

    校对:吴子悦 2019-07-25

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