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    基因检测(包括NGS)常见术语:突变丰度

    2017-08-19

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    作者: 健康全记录

    突变丰度指在某个基因位点所有的等位基因中,突变的等位基因的所占的相对比例(相对野生型等位基因)。即等于突变型/(突变型+野生型)。

    突变丰度受肿瘤细胞含量和取材等因素的影响,突变丰度与药物敏感性不一定成正相关。


    例如:

    突变丰度40%意为该位点含有40%的突变等位基因和60%的野生型等位基因。

    突变丰度5%意为该位点含有5%的突变等位基因和95%的野生型等位基因。

    突变丰度受肿瘤细胞含量和取材等因素的影响,突变丰度与药物敏感性不一定成正相关。

    ctDNA样本突变丰度一般较低,ctDNA的释放可能与肿瘤的分期、进展程度及治疗等因素均相关。

    广东省人民医院肿瘤中心吴一龙教授领衔的研究团队发现,检测表皮生长因子受体(EGFR)突变丰度,可预测表皮生长因子受体酪氨酸激酶抑制剂(EGFR-TKI)治疗非小细胞肺癌(NSCLC )的疗效。相关研究论文7月25日在线发表于《临床肿瘤学杂志》(J Clin Oncol)。

    研究者利用两种敏感度不同的检测方法——直接DNA测序法和突变特异性扩增技术对100例非小细胞肺癌患者进行EGFR突变检测。结果显示,EGFR突变量大的病人(51例),疗效较好(中位生存期为11.3个月),EGFR突变量小的病人(18例)疗效一般(中位生存期为6.9个月),两组差异非常明显。EGFR突变丰度高和低的病人,靶向药物治疗的效果均好于无突变者(31例,中位生存期为2.1个月)。

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    图1. EGFR突变丰度高者可以获得更长的PFS


    研究者称,目前,对肺癌病人,一般先检测有没有EGFR突变,如果有突变,就建议用靶向药物治疗。今后要对有EGFR突变的病人进一步分类,根据突变量的大小,决定是否用靶向药物,制定个性化治疗方案。

    此前医学界认为,符合女性、不吸烟、腺癌这3个因素的肺癌病人,使用吉非替尼或厄洛替尼这两种分子靶向药物治疗有效率可达60%。后有研究发现,基因突变才是关键因素,如果检测出有EGFR突变的肺癌病人,服用这两种分子靶向药物,治疗有效率可达70%~80%,很多晚期病人已经存活3~5年,最长7年。

    此前他们的研究已发现,与欧美等国家病人不同,中国晚期肺癌病人中30%都会出现EGFR突变的情况,据此使用靶向药物治疗,有效率可达70%以上,疗效是传统放化疗的3倍以上,晚期肺癌病人生存期可达到2年以上,传统治疗仅能维持10个月左右。

    但为什么还有20%~30%的肺癌病人有基因突变,却用药无效或者短时间后就失效?于是,他们提出了表皮生长因子受体突变丰度可能与肺癌靶向药物疗效存在一定关系的假说,并巧妙地利用了现有的不同检测方法检测EGFR突变的敏感性不同的特点,设计了探讨EGFR基因突变丰度差异性的研究,最后得出明确的量效结论——EGFR突变丰度高的病人靶向药物疗效最好,低丰度的病人效果较差,没有突变的没有效果。这项研究在国际上首次提出靶向药物量效关系的概念,并对未来肺癌更有效、更精准的个性化治疗策略提出了新的研究方向。

    【参考文献】

    1.  肺癌基因检测报告. 世和基因生物技术有限公司. 2017.6

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