非小细胞肺癌转录组亚型可以预测免疫检查点抑制剂的疗效

2019-05-03

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近年来尽管免疫检查点抑制剂的研究进展使非小细胞肺癌(NSCLC)的治疗发生了革命性的变化，但目前还没有精确的方法来预测这些药物的反应。我们开始研究基于转录组的肺腺癌(transcriptome-based molecular subtypes in lung adenocarcinoma，LUAD)和肺鳞癌(lung squamous cell carcinoma，LUSC)分子亚型是否可以预测免疫检查点抑制剂的反应。

资料和方法

从我们之前87个LUAD和101个LUSC样本中获得的转录组测序数据(N=188),我们进行无监督聚类分析，描述了多种免疫基因组决定因素包括突变、细胞溶解活动、干扰素-γ信号、免疫调节分子表达、通过使用单细胞类型分析法分析免疫细胞组成。然后，我们对35例接受抗pd -1治疗的NSCLC患者(GSE93157和巴塞罗那队列一样)的mRNA表达数据应用预测算法，检验我们基于转录组的分子分型是否能够预测抗pd -1治疗的治疗反应。

结果

对LUAD和LUSC中转录组测序数据进行聚类分析，分别发现三个（图1A）和两个（图1B）不同的聚类。聚类1在每个组织学有更高的免疫调节分子表达，更多的溶细胞活动增加，更高的干扰素-γ信号，和更丰富的免疫细胞浸润，而其他聚类（s）显著降低免疫调节分子和MHC分子，以及较低比例的免疫细胞具有较高的肿瘤纯度。因此，LUAD和LUSC中的聚类1被认为是免疫原性亚型，其他聚类被认为是免疫耐药亚型。LUAD中免疫原性亚型（聚类1） CD8 T细胞比例较高，记忆性B细胞较多，而调节性CD4 T细胞（Treg）和肿瘤相关树突状细胞比例较低。LUSC的免疫耐药亚型表现为Treg细胞浸润较多。当我们将分子亚型应用于巴塞罗那队列时，我们观察到预测的免疫原性亚型与抗pd -1治疗后的疾病控制状态一致（AUC=0.71, P=0.039, 图1C）。

结论

以非小细胞肺癌转录组测序数据进行分子分层发现的的免疫分子亚型可以预测免疫检查点抑制剂的反应。

作者：广东省肺癌研究所杨学宁 & LAMP

校对：吴子悦 2019年8月8日

【参考文献】

Hee-Jin Jang, et al . Transcriptome Subtyping of Non-Small Cell Lung Cancer May Predict Response to Immune Checkpoint Inhibitors